7 Februari
.
[7/2 19.08] Diskusi Pustaka Saga: Welcome in our IOS 2020's Group. thanks for joining us. Staytune on the schedule, please. ππ. We would like to inform that Mr. @Eirik Austad will give presentation on 07.00 PM (GMT +7).
[7/2 19.09] Diskusi Pustaka Saga: First of all, i would like to inform that out team consists of @dita (as Moderator), @Shobrina Silmi (as translator), and me (as admin group).
[7/2 19.09] Diskusi Pustaka Saga: Then, we also would like to give information about our rules in this discussion ππ
[7/2 20.00] +62 856-3205-774: Good evening ladies and gentlemen welcome back in IOS 2020 π€.
Today we have *Mr. Eirik Austad* as the keynote speaker with the topic of *Adaptation of Molecular Technology in Aquaculture: CRISPR/Cas9*.
First, I would introduce myself. I am Dita Wisudyawati, a MSc graduates of Wageningen University and Research, the Netherlands.
In this case, I am responsible as the event organizer of IOS and the host of IOS group today.
We also have a translator to help us in translation if it's necessary. Her name is Ms. Shobrina. Ms. Shobrina the floor is yours πππ».
[7/2 20.07] +62 856-3205-774: Thank you very much for time and help Ms. Shobrinaπππ».
Hope everything goes well today.
Here we go, ladies and gentlemen...today we have the order of IOS as following :
1. Introduction by Mr. Eirik
2. Presentation of the topic by Mr. Eirik
3. Discussion
4. Closing including conclusion statement by Mr. Eirik
5. Closing by me as the host.
So let's start IOS today. Mr. Eirik, the floor is yours πππ»
[7/2 20.08] +47 970 96 353: Hi everyone, my name is Eirik Austad. I have a master’s degree in developmental biology & physiology from the University of Bergen, Norway. Thank you very much to the organizers for the opportunity to join this IOS.
[7/2 20.08] +47 970 96 353: For this discussion I will summarize my master thesis and then relate it to aquaculture. Its relevance to aquaculture may not be obvious in the beginning but bear with me.
[7/2 20.09] +47 970 96 353: The mutation caused a loss of function in stub1, which in humans is thought to cause nerve death due to accumulation of misfolded protein within the cells, causing toxic protein aggregates. Phenotypes consistent with humans and mouse models was discovered in the thesis.
[7/2 20.09] +47 970 96 353: So, what in the whole wide world do this in any way relate to aquaculture? Of interest here is that this thesis was performed at a department specializing in fish physiology in relation to aquaculture, which shows the adaptability of methods in between fields.
[7/2 20.10] +47 970 96 353: For example, the main method used in the thesis, immunohistochemistry (the visualization of specific proteins in tissues) is used in aquaculture to visualize the different ion pumps in the gills in salmon at fresh the freshwater and saltwater stage. This gives useful insight into the physiological changes in salmon as it migrates from freshwater to saltwater.
[7/2 20.11] +47 970 96 353: The formation of CRISPR zebrafish mutant lines gives insight into the possibility of using CRISPR as a tool in aquaculture related species. Experiments on such species has in fact already been performed, like the creation of sterile salmon. Sterility was induced on the F0 generation, and these fish was showed to have no germ cells. The use of CRISPR to create sterile fish could prevent farm salmon to breed with the wild salmon population. Using sterile fish, the negative consequences of early sexual maturation in salmon is also avoided.
[7/2 20.12] +47 970 96 353: CRISPR could also be used to enhance useful traits like the speed of growth. Traits like disease resistance could also be useful to decrease mortality, and also decrease the ecological impact of aquaculture by reducing the amount of sick fish concentrated in one place.
[7/2 20.13] +47 970 96 353: Of interest to Norwegian aquaculture is the prospect of creating salmon resistant to the parasitic sea lice (Lepeophtheirus salmonis), as they cause as great physical damage on the fish and as a consequence, massive economic damage as well (Ca. 570 million USD annually).
[7/2 20.16] +47 970 96 353: An enticing possibility here is that the Pacific salmon, coho salmon (Oncorhynchus gorbuscha) has been showed to be largely resistant to sea lice. This resistance is due to a difference in just two base pairs, making the prospect of transferring this resistance to the Atlantic salmon (Salmo salar) used in Norway an interesting prospect.
[7/2 20.18] +47 970 96 353: While the potential of CRISPR in aquaculture is great, it is by no means a “quick fix “to the problem connected to aquaculture. Critics to the use of CRISPR in aquaculture points to the unknown effects on the introduction of new genetic material on ecosystems, and that many of the problems CRISPR is thought to solve could also be solved by other means. There are also several legal restrictions on the use of CRISPR, especially in Europe.
[7/2 20.19] +47 970 96 353: On a conclusionary note, I hope this short text will contribute to a discussion on cross-field adaptation of technology to aquaculture, especially CRISPR. Please tell me if something was unclear. I will now attempt to answer any questions.
[7/2 20.20] +62 856-3205-774: So is that all what you want present, Mr. Eirik?
[7/2 20.20] +47 970 96 353: Yes, it was.
[7/2 20.23] +62 856-3205-774: Okay...thank you for your presentation Mr. Eirik. Your topic is interesting πππ».
Now is the discussion time. Is there anybody who wants to ask or give opinion?
[7/2 20.26] +62 856-3205-774: Well...there is a participant who wants to ask some questions but he is not available to join IOS now so he asked me to ask his questions (hours before IOS starts).
[7/2 20.27] +47 970 96 353: Alright, lets hear π
Translate
[7/2 20.09] +62 856-4662-9888: Topik hari ini membahas mengenai mutasi gen ikan yang dipicu sistem CRISPR-Cas9 ( _Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats_ -Cas9) pada gen stub1 yang berperan dalam proses penghancuran lipatan protein yang salah.
[7/2 20.10] +62 856-4662-9888: Mutasi yang disebabkan oleh kerusakan fungsi gen stub1 pada manusia diduga menjadi penyebab kematian syaraf, karena adanya akumulasi lipatan protein yang salah di sel, sehingga menghasilkan agregat protein toksik.
[7/2 20.10] +62 856-4662-9888: Topik ini akan lebih membahas mengenai metode penelitian untuk sektor akuakultur melalui hasil adaptasi dari sektor yang berbeda.
[7/2 20.10] +62 856-4662-9888: Contoh yang sering ditemukan adalah penggunaan imunohistokimia (visualisasi protein spesifik pada jaringan) di akuakultur untuk menunjukkan pemompaan ion berbeda pada insang salmon di fase lingkungan air tawar dan laut. Metode ini memberikan gagasan baru mengenai perubahan fisiologi pada salmon, ketika bermigrasi dari perairan tawar ke laut.
[7/2 20.11] +62 856-4662-9888: Gambar ini merupakan contoh Imunohistokimia pada jaringan insang salmon yang menunjukkan transporter NKA Ξ±1a (Ξ±1a) dan NKA Ξ±1a (Ξ±1b) di ionosit (McCormick et. Al 2013). Jumlah sel (Ξ±1a) menghilang setelah migrasi ke air laut, sementara sel (Ξ±1b) meningkat, ketika salmon perlu mensekresikan ion pada air laut.
[7/2 20.12] +62 856-4662-9888: Pembentukan CRISPR pada ikan zebra mutan yang digunakan memberikan pandangan baru mengenai kemungkinan penggunaan CRISPR pada spesies akuakultur. Percobaan sebelumnya juga telah dilakukan, misalnya pembuatan salmon steril. Sterilitas dipicu pada generasi F0, ditunjukkan dengan tidak adanya sel gamet. Penggunaan CRISPR untuk membuat ikan steril mampu mencegah salmon budidaya untuk memijah dengan salmon liar, selain menghindari adanya kematangan seksual yang lebih cepat pada salmon.
[7/2 20.13] +62 856-4662-9888: CRISPR juga dapat digunakan untuk memicu pengekspresian sifat yang berguna, seperti pertumbuhan cepat, resistensi penyakit, dan penurunan dampak lingkungan karena adanya aktivitas akuakultur.
[7/2 20.16] +62 856-4662-9888: contohnya adalah adanya prospek menciptakan salmon yang resisten terhadap parasit _Lepeophtheirus salmonis_ karena menyebabkan kerusakan fisik ikan dan menyebabkan penurunan nilai ekonomi ikan salmon hingga 570 juta dolar per tahun
[7/2 20.18] +62 856-4662-9888: resistensi coho salmon ( _Oncorhynchus gorbuscha_ ) terhadap parasit _Lepeophtheirus salmonis_ akibat adanya perbedaan pada dua pasang basa ekspresi gen resisten, sehingga prospek transfer gen resisten ini pada salmon Atlantik ( _Salmo salar_ ) dapat dimungkinkan bisa dilakukan melalui CRISPR.
[7/2 20.19] +62 856-4662-9888: Potensi CRISPR pada sektor akuakultur sangat tinggi, namun bukan berarti mampu menyelesaikan permasalahan akuakultur lebih cepat. Penggunaan CRISPR pada akuakultur dikritik menyebakan efek negatif yang belum diketahui akibat introdusir materi genetik baru pada ekosistem, selain adanya beberapa pembatasan legal terhadap penggunaan CRISPR, khususnya di Eropa.
[7/2 20.28] +62 856-4662-9888: bagaimana protein yang terlipat salah ini disintesis dalam sel? Apakah dikodekan oleh gen tertentu? Jika iya, apakah mungkin untuk memotong gen ini menggunakan CRISPR/Cas9?
[7/2 20.33] +62 856-4662-9888: protein yang terlipat salah merupakan protein yang kehilangan struktur aslinya karena adanya perubahan suhu/pH. Secara normal, ada sistem dalam sel yang mampu menghancurkan jenis protein ini, namun ketika protein ini berakumulasi, maka proses penghancuran mengalami gangguan, sehingga menyebabkan kematian sel.
[7/2 20.44] +62 856-4662-9888: Apa alasan utama CRISPR dilarang di Eropa, meski memiliki keuntungan dengan mampu menghasilkan salmon yang resisten parasit? Apakah karena akan menciptakan mutan yang merusak keseimbangan ekologi?
[7/2 20.46] +62 856-4662-9888: Alasan kenapa CRISPR dilarang di Eropa karena metode ini menciptakan _Genetically modified organism_ (GMO) yang mampu merusak keseimbangan ekologi. Apabila organisme ini keluar dan memijah dengan spesies organisme liar, hal ini bisa merugikan.
[7/2 20.53] +62 856-4662-9888: Mekanisme ekspresi gen resistensi parasit adalah dengan mempeerbaiki gene relevan di salmon Atlantik yang menyebabkan resistensi di spesies lain, sehingga dapat direplikasi pada salmon
[7/2 21.02] +62 856-4662-9888: Bagaimana cara para peneliti mengidentifikasi crispr gen pada ikan ? Apakah prosesnya harus membutuhkan alat" berteknologi tinggi ?
[7/2 21.15] +62 856-4662-9888: Sekuen gen yang dimaksud dapat diketahui melalui bioinformatika dan penelitian sekuensing untuk menemukan berbagai gen. Karena CRISPR menggunakan RNA yang komplementer dengan sekuen target, maka RNA ini harus diketahui sebelumnya. Sebelum penggunaan CRISPR, penggunaan mutagen dilakukan untuk memicu terjadinya mutasi acak, kemudian baru menemukan gen mana yang dimutasi. Melalui CRISPR, kita bisa lekakukan hal sebaliknya dengan mengetahui gen mana yang bisa memicu mutasi, sehingga metode ini lebih mudah dan siap digunakan.
[7/2 21.17] +62 856-4662-9888: Lalu, apa kekurangan adanya penemuan metode CRISPR?
[7/2 21.27] +62 856-4662-9888: salah satu kekurangan CRISPR adalah ketidakpastian sekuen yang diperbaiki, apakah sekuen target yang diperbaiki berpengaruh terhadap sekuen lain dalam genom, sehingga terjai mutasi yang tidak diinginkan. Meskipun murah dan mudah, CRISPR sangat sulit untuk dilakukan karena adanya pembatasan regulasi.
[7/2 21.42] +62 856-4662-9888: apakah sudah ada ikan modifikasi genetik menggunakan CRISPR/Cas9 yang sudah diproduksi massal pada budidaya saat ini? Jika iya, apa perbedaan dari ikan lain yang menggunakan teknik perbaik gen ?
[7/2 21.43] +62 856-4662-9888: ikan dengan modifikasi gen menggunakan CRISPR saat ini sudah ada, namun masih dalam tahap penelitian dasar dan berpotensi diproduksi secara massal ..
[7/2 21.48] +62 856-4662-9888: Seberapa efektif kah penggunaan CRISPR/Cas9 secara ekonomi dibandingkan dengan metode triploidisasi?
[7/2 21.53] +62 856-4662-9888: Secara segi ekonomi masih belum bisa ditentukan, namun ikan triploid bermasalah berdasarkan dari segi _welfare_ dan kesehatan, sedangkan CRISPR tidak.
[7/2 21.57] +62 856-4662-9888: Apakah teknik restriksi CRISPR untuk produksi ikan modifikasi genetik menandakan, bahwa tidak ada kesempatan ikan ini untuk diaplikasikan, khususnya di Eropa?
[7/2 22.03] +62 856-4662-9888: Saat ini CRISPR masih dalam tahapan penelitian dasar di ikan, khusunya ikan konsumsi. Kedepannya, apabila ada keberhasilan yang signifikan, maka metode ini akan diaplikasikan secara massal di Eropa.
[7/2 22.16] +62 856-4662-9888: Mengadaptasi metode dari ilmu yang lain untuk pengembangan akuakultur perlu dilakukan untuk memperoleh kemungkinan terbaik dan mengatasi permasalhan yang akan terjadi di akuakultur kedepannya, seperti CRISPR/Cas9
[7/2 22.22] +62 856-3205-774: So now is my turn to close IOS today.
I personally apologize if I made mistakes and inconvenience during IOS.
I want to thank so much to :
1. Mr. Eirik for your time and your interesting topic πππ».
2. Ms. Shobrina for your time and help as translator πππ».
3. Mr. Iqbal as admin and controller of IOS groupπππ».
4. Mr. Haris and Mr. Merdeka for your questionsπππ».
5. All the participants here, in this IOS group πππ».
See you on the next topicπ€.
Tidak ada komentar:
Posting Komentar